Tom Sawyer, un garçonnet espiègle, vit avec sa tante Polly dans le village de Hannibal sur les bords du Mississippi. Au cours d'une escapade nocturne avec un camarade, Huckleberry Finn, il est témoin du meurtre du docteur Robinson par un propre-à-rien surnommé Injun Joe. Lorsqu'un innocent est accusé du meurtre, Tom révèle en cour ce qu'il a vu et s'attire ainsi l'inimitié d'Injun Joe qui s'enfuit. Au cours d'un pique-nique, le jeune garçon s'aventure dans des cavernes avec une petite amie et y fait la rencontre du meurtrier. Les enfants sont rescapés avant qu'Injun Joe ait pu leur faire un mauvais parti.